More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0250 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  100 
 
 
400 aa  790    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  68.73 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04690  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  65.62 
 
 
420 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  62.64 
 
 
367 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  59.94 
 
 
349 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4335  ABC transporter related  57.31 
 
 
365 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  61.76 
 
 
339 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  53.35 
 
 
401 aa  363  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  49.55 
 
 
339 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
339 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1652  ABC transporter related protein  53.87 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 
339 aa  328  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  48.66 
 
 
342 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  47.94 
 
 
344 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  47.28 
 
 
388 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
342 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  49.84 
 
 
345 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  47.13 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
341 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
341 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
341 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
341 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  47.95 
 
 
352 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 
341 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.13 
 
 
335 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.09 
 
 
350 aa  300  3e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
341 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
341 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  45.78 
 
 
341 aa  299  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
345 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 
341 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
350 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.61 
 
 
331 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.54 
 
 
335 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.54 
 
 
335 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.71 
 
 
343 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  47.46 
 
 
347 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.26 
 
 
344 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.54 
 
 
335 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
335 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
341 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
335 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  45.26 
 
 
342 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  45.26 
 
 
342 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
344 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.94 
 
 
335 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.11 
 
 
344 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0421  ABC transporter related  50.16 
 
 
341 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
335 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.47 
 
 
335 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  49.38 
 
 
387 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.06 
 
 
343 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  44.85 
 
 
337 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.77 
 
 
382 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 
368 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.87 
 
 
335 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
341 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  46.87 
 
 
343 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.39 
 
 
350 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.09 
 
 
335 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
341 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
348 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
344 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.17 
 
 
310 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
348 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.42 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.71 
 
 
343 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
346 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 
344 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  44.07 
 
 
340 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
346 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.51 
 
 
343 aa  285  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
349 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
346 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 
343 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
346 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>