More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4335 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4335  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  63.17 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  57.31 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  58.49 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04690  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  57.57 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  53.08 
 
 		 367 aa  351  8.999999999999999e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  54.75 
 
 		 339 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  48.37 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  51.43 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0421  ABC transporter related  48.33 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  44.98 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  44.48 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1652  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  43.81 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  42.06 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  42.73 
 
 		 352 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.26 
 
 		 343 aa  282  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  49.43 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  49.43 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  44.79 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.28 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  47 
 
 		 368 aa  279  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  45.65 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 342 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  43.67 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  43.37 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  43.85 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 		 335 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  41.64 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0402  ABC transporter related  45.15 
 
 		 337 aa  271  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280128  normal  0.577694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.99 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  42.46 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  44.71 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.28 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  45.67 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>