More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0805 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  100 
 
 
322 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  70.22 
 
 
320 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  68.11 
 
 
318 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0931  ABC-type metal ion transport system ATPase component  69.28 
 
 
332 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  46.94 
 
 
352 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
343 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.08 
 
 
344 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  48.36 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.82 
 
 
343 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  50.62 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.22 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.87 
 
 
349 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 
343 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
344 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.93 
 
 
343 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  51.52 
 
 
328 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
328 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.93 
 
 
343 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.87 
 
 
349 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
328 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.22 
 
 
343 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
385 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.26 
 
 
344 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.63 
 
 
343 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1774  ABC transporter related protein  58.19 
 
 
320 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.63 
 
 
343 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.34 
 
 
343 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
343 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
345 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
342 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
385 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
385 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 
344 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
343 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
344 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.54 
 
 
359 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  47.04 
 
 
345 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
350 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
344 aa  288  7e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  45.24 
 
 
342 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.26 
 
 
344 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  50 
 
 
351 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  46.43 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
339 aa  285  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
339 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
344 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.67 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  44.35 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  47.17 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  47.17 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  47.8 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
339 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
341 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  44.62 
 
 
339 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>