More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2760 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10510  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  55.81 
 
 
346 aa  339  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0663634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 
339 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
343 aa  319  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
343 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  47.59 
 
 
340 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
343 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
343 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
343 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  47.24 
 
 
339 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
343 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  47.02 
 
 
344 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 
343 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  52.87 
 
 
318 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
339 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 
343 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.99 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  50.31 
 
 
332 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 
344 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.35 
 
 
343 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
322 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 
344 aa  296  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 
343 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 
343 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 
345 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  52.88 
 
 
354 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.58 
 
 
344 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
342 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
328 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  46.83 
 
 
328 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 
328 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.17 
 
 
344 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  42.14 
 
 
342 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.49 
 
 
368 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.76 
 
 
382 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 
341 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  45.38 
 
 
351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  43.95 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0931  ABC-type metal ion transport system ATPase component  48.62 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  46.11 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
397 aa  281  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
337 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  45.15 
 
 
340 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
341 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
341 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
341 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.58 
 
 
344 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
341 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
341 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
349 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  43.64 
 
 
341 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  44.55 
 
 
341 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
338 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  44.55 
 
 
341 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.87 
 
 
350 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
341 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 
349 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 
344 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
341 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
341 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
341 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.81 
 
 
344 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  45.67 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  40.06 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47 
 
 
356 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 
341 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0625  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
325 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
350 aa  272  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 
344 aa  271  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  41.32 
 
 
352 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  40.81 
 
 
350 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 
348 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 
344 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 
344 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>