More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1244 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  76.35 
 
 		 262 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  73.77 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  71.78 
 
 		 251 aa  354  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3213  ABC transporter related  73.44 
 
 		 250 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.88 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  44.26 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  44.3 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  43.04 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  42.54 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  42.13 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.89 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.68 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.36 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  41.44 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  44.78 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  41.45 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.22 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  42.28 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  42.28 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.45 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  41.74 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.43 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 277 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  39.57 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.06 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.91 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  39.6 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  39.04 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.11 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.11 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.11 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  42.8 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  41.05 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  41.05 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.98 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39.32 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  38.71 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  38.71 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  38.31 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  39.48 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  38.6 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  41.56 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  40.6 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 296 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  39.39 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  40.34 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.43 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.45 
 
 		 333 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 		 294 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  39.32 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.09 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  38.74 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  37.99 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  41.86 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  39.02 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.49 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  40.43 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  40.6 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  38.89 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  41.52 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  40.69 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  41.67 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.13 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.06 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.77 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  39.74 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  41.51 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  36.32 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  39.06 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  37.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>