More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2969 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  88.24 
 
 		 238 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  86.13 
 
 		 238 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  72.69 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  60.33 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  61.32 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  49.36 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  48.4 
 
 		 252 aa  188  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  49.78 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  44.26 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.23 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  44.49 
 
 		 258 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  44.49 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  45.89 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.35 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  45.61 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  37.28 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  39.65 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  45.37 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  40.35 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  46.83 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  41.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.62 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  35.6 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.45 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  32.91 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  40.66 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0578  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0444  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.79 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.55 
 
 		 278 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 258 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.92 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.73 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.03 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2182  phosphate transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508405  normal  0.137715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  32.28 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.93 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.87 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0190  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 		 329 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  43.72 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  34.9 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0885  phosphate transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1021  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  0.000000448659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  35.27 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4446  phosphate transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 282 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0574  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0783  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1621  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1518  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1488  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2770  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0577  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1294  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>