More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2222 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  62.81 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  61.98 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  60.58 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  62.34 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  61.64 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  60.58 
 
 		 239 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  58.68 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  47.06 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  46.64 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  48.2 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  47.11 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.23 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  48.92 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  45.45 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  47.83 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  40.52 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  44.23 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  44.54 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  50.21 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  49.57 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  39.66 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  36.56 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  35.11 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  35.98 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  39.22 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  39.68 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  39.91 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  39.04 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  36.91 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  36.24 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  36.52 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  34.82 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  36.52 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  39.56 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  35.71 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  37.23 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  35.39 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  36.51 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  34.06 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  36.64 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  39.3 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  36.73 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  40.17 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  35.27 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  33.74 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.41 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  36.73 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  36.48 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  36.24 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  32.64 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  35.65 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.84 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  33.89 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  36.67 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  35.34 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  36.21 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.41 
 
 		 364 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  33.19 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  37.97 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  35.56 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>