More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2475 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  97.29 
 
 
258 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  65.11 
 
 
229 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  64.1 
 
 
229 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  63.52 
 
 
239 aa  284  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.81 
 
 
238 aa  265  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  61.6 
 
 
249 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  57.44 
 
 
239 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  42.41 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  44.12 
 
 
251 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  44.49 
 
 
238 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  44.44 
 
 
238 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  42.98 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  43.16 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  40.98 
 
 
252 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
247 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.59 
 
 
247 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
240 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
242 aa  148  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  35.2 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  36.73 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  32.79 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
240 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  38.87 
 
 
245 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  33.76 
 
 
235 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
259 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  34.22 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  35.92 
 
 
241 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
251 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  33.61 
 
 
242 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  43.21 
 
 
240 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  34.01 
 
 
255 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 
264 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  31.97 
 
 
248 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  32.24 
 
 
258 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
253 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.78 
 
 
364 aa  141  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.13 
 
 
240 aa  141  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  37.5 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  38.06 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  33.61 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  36.21 
 
 
249 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  36.17 
 
 
250 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
284 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.99 
 
 
243 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
240 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  34.47 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.73 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  34.47 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  35.92 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 
249 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  37.04 
 
 
243 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  33.47 
 
 
252 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
252 aa  138  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  32.65 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  33.2 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  33.47 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  38.18 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  31.47 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  37.29 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  34.02 
 
 
240 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 
260 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  32.65 
 
 
240 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  33.61 
 
 
246 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  34.01 
 
 
246 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  33.46 
 
 
261 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.29 
 
 
244 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  35.22 
 
 
260 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
240 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  36.99 
 
 
243 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  30.4 
 
 
244 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  32.65 
 
 
249 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  35.6 
 
 
257 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
270 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  32.13 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  35.86 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  33.62 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  34.26 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  34.19 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  38.21 
 
 
244 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  35.1 
 
 
260 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  33.86 
 
 
261 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  34.77 
 
 
252 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  34.47 
 
 
239 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
240 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  32.65 
 
 
249 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  40.68 
 
 
236 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  35.51 
 
 
259 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.47 
 
 
258 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  35.39 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>