More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2436 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  79.58 
 
 
240 aa  351  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  53.39 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  49.58 
 
 
252 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  51.26 
 
 
238 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  51.26 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  47.41 
 
 
244 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  48.9 
 
 
251 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  49.78 
 
 
238 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  54.11 
 
 
244 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  45.81 
 
 
229 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  49.16 
 
 
236 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.93 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.86 
 
 
238 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  50.22 
 
 
243 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  47.83 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  37.07 
 
 
240 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  40.08 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
239 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.42 
 
 
256 aa  158  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  43.21 
 
 
258 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  43.21 
 
 
258 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.44 
 
 
258 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  35.86 
 
 
244 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.29 
 
 
364 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  37.65 
 
 
272 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  44.8 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.43 
 
 
244 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
365 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  36.68 
 
 
235 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  37.12 
 
 
235 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
255 aa  141  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  42.24 
 
 
364 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  34.21 
 
 
352 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  36.13 
 
 
259 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
240 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  37.15 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  36.82 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  33.05 
 
 
240 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  40.25 
 
 
359 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
264 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.36 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  36.55 
 
 
250 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  40.09 
 
 
356 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  36.44 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  30.64 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  38.84 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 
343 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  30.64 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  35.9 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  40.89 
 
 
334 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  34.89 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  38.72 
 
 
350 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
253 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
253 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  38.39 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  39.74 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  36.82 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  41.23 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  36.36 
 
 
356 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
260 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  38.79 
 
 
527 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  34.5 
 
 
342 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  41.81 
 
 
368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  36.17 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 
355 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  32.52 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  36.91 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  34.2 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  39.17 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  32.9 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  37.3 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  33.62 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
254 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  34.76 
 
 
253 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40.26 
 
 
358 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  33.77 
 
 
357 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  36.07 
 
 
344 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
352 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  36.4 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  39.39 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  37.61 
 
 
353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 
354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>