More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2629 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  100 
 
 
337 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  51.49 
 
 
212 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0232  ATPase  49.52 
 
 
226 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  44.2 
 
 
219 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2782  ABC transporter related  50.25 
 
 
284 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  38.79 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
223 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 
247 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  34.9 
 
 
334 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  40.19 
 
 
256 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  35.62 
 
 
244 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.22 
 
 
244 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.11 
 
 
364 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
246 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  33.94 
 
 
258 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0204  protein YabJ  37.39 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  37.27 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  38.84 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.27 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  35.59 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  37.33 
 
 
347 aa  133  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0029  ABC transporter related  37.14 
 
 
242 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000212578  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5881  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  34.45 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  36.8 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  36.04 
 
 
250 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  35.53 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1709  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.32 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  35.59 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  37.56 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.07 
 
 
367 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  36.4 
 
 
292 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3858  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  40.89 
 
 
257 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
346 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  33.04 
 
 
351 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  37.5 
 
 
353 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  33.04 
 
 
346 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.83 
 
 
380 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  31.06 
 
 
373 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.23 
 
 
348 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  39.27 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
346 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
346 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
346 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
346 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  37.5 
 
 
353 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  34.51 
 
 
349 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
346 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  34.65 
 
 
338 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.68 
 
 
288 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  35.75 
 
 
331 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
346 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
346 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1523  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.02 
 
 
331 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3754  hypothetical protein  39.9 
 
 
239 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  36.5 
 
 
353 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  31.18 
 
 
350 aa  124  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  36.19 
 
 
343 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
316 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  30.98 
 
 
357 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3636  ABC transporter related  34.91 
 
 
369 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1890  tungsten ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.92 
 
 
331 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  36.02 
 
 
328 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0791  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
239 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  34.33 
 
 
250 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  42.65 
 
 
240 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.8 
 
 
393 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.95 
 
 
369 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 
395 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  36.52 
 
 
536 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0399  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
249 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  33.66 
 
 
372 aa  123  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.61 
 
 
347 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  38.02 
 
 
359 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.25 
 
 
562 aa  122  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.13 
 
 
395 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  35.68 
 
 
349 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  34.42 
 
 
344 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.82 
 
 
360 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.8 
 
 
374 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  30.8 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.8 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  32.28 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
255 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  36.24 
 
 
566 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.74 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  37.96 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.28 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  34.36 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  35.22 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  36.62 
 
 
569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>