More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1776 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  47.83 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0232  ATPase  46.01 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2782  ABC transporter related  46.48 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  36.1 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.99 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  41.78 
 
 		 337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.61 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  37.07 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  43.46 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  39.29 
 
 		 334 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  41.24 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  39.72 
 
 		 356 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  40.51 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1453  cell-division ATP-binding protein  35.29 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  40.72 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  37.61 
 
 		 229 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  34.22 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 353 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  39.69 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 354 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  38.19 
 
 		 342 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  34.84 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  35.75 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  40.2 
 
 		 341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  40.21 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 374 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 365 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 		 352 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  39.05 
 
 		 352 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 375 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 375 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 375 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  40 
 
 		 378 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 		 351 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  34.42 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  35.41 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  39.8 
 
 		 345 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.63 
 
 		 377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  35.75 
 
 		 360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  36 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 371 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  32.46 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  41.67 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  41.67 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  37.81 
 
 		 378 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  39.18 
 
 		 360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  38.43 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.62 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  35.68 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  36.62 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0798  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  37 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 377 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 377 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  37.37 
 
 		 368 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 369 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0792  ABC transporter related  39.05 
 
 		 325 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  38.57 
 
 		 352 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  37 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  37.02 
 
 		 360 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  35 
 
 		 365 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 375 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 352 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  34.9 
 
 		 365 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  37 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 352 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  39.63 
 
 		 323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  39.69 
 
 		 367 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3500  ABC transporter related  39.41 
 
 		 348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  39.41 
 
 		 348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>