More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0927 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 		 247 aa  214  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  45.54 
 
 		 334 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  39.91 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  40.1 
 
 		 337 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  37.79 
 
 		 240 aa  148  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 		 365 aa  148  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.48 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.78 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.5 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  38.89 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  38.89 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  38.6 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  37.76 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.62 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  41.2 
 
 		 333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.59 
 
 		 359 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 340 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.5 
 
 		 364 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  38.25 
 
 		 351 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  41.92 
 
 		 359 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  36.99 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  36.11 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  37.38 
 
 		 360 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 353 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 348 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 353 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.03 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 349 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  41.67 
 
 		 343 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 		 377 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 347 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  37.38 
 
 		 356 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  40.7 
 
 		 353 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.5 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  41.24 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.12 
 
 		 362 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  33.03 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  36.92 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 		 349 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  35.98 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  36.74 
 
 		 349 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  35.68 
 
 		 353 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 		 348 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 		 372 aa  128  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 316 aa  128  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.86 
 
 		 402 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  39.78 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1268  cell division ATP-binding protein FtsE  37.38 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  35.59 
 
 		 258 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  42.01 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.14 
 
 		 426 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.81 
 
 		 372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.7806299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.16 
 
 		 367 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.4 
 
 		 352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  36.53 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  36.87 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  36.87 
 
 		 371 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  36.92 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 		 370 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  36.79 
 
 		 348 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.8 
 
 		 363 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  36.92 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.7 
 
 		 384 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 372 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  36.45 
 
 		 360 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 363 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  35.59 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 343 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  43.11 
 
 		 364 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  38.71 
 
 		 353 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  36.92 
 
 		 360 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  36.28 
 
 		 353 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  36.92 
 
 		 360 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 		 387 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1292  ABC transporter related  36.24 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.577563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  36.92 
 
 		 363 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  39.72 
 
 		 342 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  42.16 
 
 		 368 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  36.36 
 
 		 356 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 		 381 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 348 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.81 
 
 		 371 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  37.21 
 
 		 329 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  38.35 
 
 		 378 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  35.62 
 
 		 350 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  37.86 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  35.05 
 
 		 342 aa  124  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 		 374 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.61 
 
 		 361 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  35.55 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.49 
 
 		 384 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>