More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2005 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  93.65 
 
 
378 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  100 
 
 
378 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  61.28 
 
 
394 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  56.41 
 
 
351 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  49.21 
 
 
542 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2098  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
385 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  47.21 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  46.63 
 
 
369 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  46.63 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  46.63 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  46.63 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  47.06 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
337 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.08 
 
 
357 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
365 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  48.59 
 
 
365 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
365 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
337 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
337 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.75 
 
 
374 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  43.95 
 
 
352 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  43.22 
 
 
344 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  46 
 
 
362 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 
384 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  45.78 
 
 
366 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.51 
 
 
366 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  50 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  48.5 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  43.69 
 
 
379 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
351 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 
342 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.32 
 
 
373 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  43.44 
 
 
358 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6246  ABC transporter related  47 
 
 
359 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836052  normal  0.532087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 
360 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.95 
 
 
381 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.33 
 
 
359 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  49.66 
 
 
363 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.82 
 
 
362 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.71 
 
 
358 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46 
 
 
356 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.07 
 
 
348 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 
352 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 
372 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.39 
 
 
384 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  45.21 
 
 
342 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  44.16 
 
 
353 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
348 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  44.9 
 
 
358 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
380 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.07 
 
 
347 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  45.1 
 
 
365 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.27 
 
 
382 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  50.63 
 
 
363 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  50.21 
 
 
363 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.94 
 
 
376 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.54 
 
 
359 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
343 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.71 
 
 
360 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
368 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.38 
 
 
360 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.92 
 
 
363 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
384 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
382 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.74 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  45.91 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  45.91 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.74 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  50.21 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  45.91 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.33 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  44.16 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.45 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  38.53 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  45.15 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  50.21 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.54 
 
 
338 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 
361 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  45.96 
 
 
366 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  42.81 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  44.83 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  44.91 
 
 
384 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
408 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  51.5 
 
 
360 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  51.5 
 
 
360 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.12 
 
 
363 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
367 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  50.54 
 
 
361 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  46.21 
 
 
384 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>