More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6149 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  94.17 
 
 
358 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  89.72 
 
 
360 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
360 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  73.09 
 
 
376 aa  524  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  68.17 
 
 
363 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
374 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 
355 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.72 
 
 
376 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  49.4 
 
 
374 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.93 
 
 
355 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  50.78 
 
 
365 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.4 
 
 
374 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.11 
 
 
374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.14 
 
 
355 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.92 
 
 
355 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.3 
 
 
374 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.28 
 
 
359 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.82 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.25 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.7 
 
 
365 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.52 
 
 
393 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.43 
 
 
358 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.65 
 
 
368 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  48.63 
 
 
363 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.17 
 
 
365 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.62 
 
 
349 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.63 
 
 
395 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4321  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 
363 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.412011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
351 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  46.97 
 
 
384 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.34 
 
 
360 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4696  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.28 
 
 
364 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.91 
 
 
368 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  47.24 
 
 
349 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 
393 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.03 
 
 
357 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  46.24 
 
 
373 aa  292  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.63 
 
 
384 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4665  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
380 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.879572  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
384 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  47.42 
 
 
384 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 
364 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 
360 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 
364 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.11 
 
 
366 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.37 
 
 
381 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
364 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2933  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.61 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927824  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0466  ABC transporter related  45.4 
 
 
361 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305347  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
368 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
364 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 
364 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  45.63 
 
 
382 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
363 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1734  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1467  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765075  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1518  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0467578  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.67 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.11 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4045  ABC transporter related  46.99 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6888  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 
365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0550256  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3812  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3296  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.22 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  43.47 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 
361 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  45.07 
 
 
365 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
373 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  44.89 
 
 
379 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  45.35 
 
 
382 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  41.62 
 
 
361 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  45.35 
 
 
382 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.62 
 
 
361 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.72 
 
 
364 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  43.88 
 
 
358 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  45.35 
 
 
382 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0642  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  56.64 
 
 
370 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.680948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  50.32 
 
 
364 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4690  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 
379 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3609  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.56 
 
 
370 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00717179  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 
353 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4448  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  57.56 
 
 
370 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3918  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.56 
 
 
370 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.23 
 
 
360 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  45.05 
 
 
382 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
357 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.94 
 
 
366 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
351 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 
365 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.73 
 
 
372 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  44.41 
 
 
368 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>