More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003506 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  96.65 
 
 
239 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  75.31 
 
 
240 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  69.59 
 
 
224 aa  318  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  40.83 
 
 
236 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  40.42 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  39.58 
 
 
236 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  40.93 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  40.93 
 
 
235 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  41.77 
 
 
235 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  40.64 
 
 
236 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
235 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  40.09 
 
 
249 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  38.27 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  39.72 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  37.32 
 
 
221 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  37.5 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 
247 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  38.43 
 
 
334 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  37.76 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  32.57 
 
 
229 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  34.09 
 
 
212 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  31.9 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  30.45 
 
 
244 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  36.81 
 
 
206 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
228 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  37.36 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  34.88 
 
 
337 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
341 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  35.91 
 
 
225 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
249 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  32.23 
 
 
351 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.85 
 
 
258 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  29.63 
 
 
258 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  34.26 
 
 
225 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4598  ABC transporter related  32.72 
 
 
293 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.7 
 
 
541 aa  106  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  34.17 
 
 
235 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  30.56 
 
 
258 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  34.18 
 
 
240 aa  105  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
333 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  33.02 
 
 
239 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  39.24 
 
 
353 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  35.47 
 
 
867 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  27.19 
 
 
237 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  30.73 
 
 
242 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  33.18 
 
 
568 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  33.93 
 
 
256 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  35.44 
 
 
337 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  34.2 
 
 
212 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
274 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.88 
 
 
238 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  34.76 
 
 
243 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.31 
 
 
450 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
246 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  31.63 
 
 
219 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  37.37 
 
 
232 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1697  ABC transporter related  27.63 
 
 
237 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 
242 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  30.3 
 
 
238 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 
354 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 
333 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  34.69 
 
 
250 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  35.81 
 
 
347 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  39.23 
 
 
333 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  37.63 
 
 
368 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  31.94 
 
 
235 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
366 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 
376 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  33.33 
 
 
290 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.67 
 
 
285 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15620  ABC transporter related  33.82 
 
 
212 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
333 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34 
 
 
260 aa  101  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
276 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  36.87 
 
 
232 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  33.16 
 
 
332 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  31.19 
 
 
360 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 
254 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.77 
 
 
226 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  30.3 
 
 
238 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  31.31 
 
 
228 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  37.06 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  34.6 
 
 
580 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.39 
 
 
266 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  32.67 
 
 
223 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  31.86 
 
 
498 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0578  ATPase  29.28 
 
 
231 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0490127  normal  0.247992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.18 
 
 
285 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.22 
 
 
360 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  29.3 
 
 
243 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.52 
 
 
469 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  31.66 
 
 
239 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.1 
 
 
571 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>