More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2867 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  95.69 
 
 		 232 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  79.74 
 
 		 228 aa  341  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  57.45 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  60.62 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  35.21 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  37.33 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  36.87 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  34.74 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  34.74 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  36.87 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  36.45 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  36.41 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  36.67 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.93 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  42.56 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  37.5 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.7 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  39.25 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  38.79 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  36.87 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  40.1 
 
 		 334 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.02 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  38.59 
 
 		 368 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  37.74 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.75 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  36.07 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  37.5 
 
 		 368 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  39.22 
 
 		 495 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  37.98 
 
 		 564 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  35.9 
 
 		 372 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  40.44 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  36.41 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.84 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 		 395 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  35.33 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  36.89 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  36.73 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  41.95 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  36.87 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  37.44 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.21 
 
 		 402 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  39.66 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40.1 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  40.35 
 
 		 335 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  40.35 
 
 		 335 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.39 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  39.66 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.93 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  45.25 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  38.46 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  35.61 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  36.41 
 
 		 542 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  34 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 398 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  32.14 
 
 		 366 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  37.2 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  40.2 
 
 		 460 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.85 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.87 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  34.66 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  35.2 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  35.24 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  37.69 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  39.9 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  34.93 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  32.66 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  38.42 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 371 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  37.16 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  35.96 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.96 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.41 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  38.59 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  32.98 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>