More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3919 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  63.13 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  63.59 
 
 		 236 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  63.59 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  63.13 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  65.4 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  64.65 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  64.65 
 
 		 235 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  64.19 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  63.55 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  55.23 
 
 		 239 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  60.7 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  60.19 
 
 		 239 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  40.09 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.17 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  40.82 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  36.08 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  31.88 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  33 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  31.52 
 
 		 376 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  31.4 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  33.64 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  31.96 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  26.78 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  26.78 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1246  ATPase  35.03 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  33.5 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  30.71 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  30.47 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  28.27 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.31 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  32.99 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  33.84 
 
 		 362 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  33.5 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  29.77 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  31.25 
 
 		 358 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  30.56 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.31 
 
 		 377 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  28.5 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  28.99 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  28.99 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  30.92 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  30.33 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  28.99 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0169  ATPase  31.4 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.655769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  32.65 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  26.36 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.28 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  29.87 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  29.87 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.9 
 
 		 568 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 		 337 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.17 
 
 		 594 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  32.09 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.1 
 
 		 386 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.17 
 
 		 594 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  31.09 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1128  ABC transporter related  32.99 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  32.04 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  32.12 
 
 		 351 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 		 301 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  30.18 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.46 
 
 		 534 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.63 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  33.33 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.63 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.63 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  29.17 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08011  ABC transporter ATP-binding protein  31.4 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.969375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  30.77 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  33.69 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  32.34 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.9 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  28.82 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  30.88 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  36.27 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  36.84 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  30.85 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.65 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  30.85 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  32.84 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 386 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  28.04 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.1 
 
 		 387 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  32.62 
 
 		 366 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1325  ABC transporter related  30.95 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.1 
 
 		 386 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3546  ABC transporter related  33.51 
 
 		 573 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>