More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0122 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  55.6 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  55.6 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  55.17 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  57.71 
 
 		 249 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  52.16 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  51.38 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  47.7 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  48.54 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.45 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  42.31 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  39.29 
 
 		 221 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.02 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  32.46 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  36.67 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  36.14 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  33.64 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  32.74 
 
 		 360 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  32.71 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  32.24 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.92 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  32.71 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  34.93 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0742  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0290801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  33.33 
 
 		 364 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  32.58 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  32.24 
 
 		 250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  31.62 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  30.51 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  31.75 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  32.62 
 
 		 325 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  32.26 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  35.53 
 
 		 291 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  31.88 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  31.88 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.72 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  40 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  31.36 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  31.36 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  31.36 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  32.09 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  31.86 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  32.26 
 
 		 432 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  32.26 
 
 		 432 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  30.87 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.08 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.7 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.18 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  31.16 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  30.7 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  30.35 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  31.08 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  33.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  31.94 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.35 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  29.5 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.68 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.35 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  33.33 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  28.77 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  29.36 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  41.53 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  31.73 
 
 		 267 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  34.8 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  30.63 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  34.11 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  32.54 
 
 		 365 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  31.36 
 
 		 265 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  30.39 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  33 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  30.39 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  33 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  30.39 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  32.39 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.62 
 
 		 367 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  38.97 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  33.78 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1697  ABC transporter related  31.63 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  30.18 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  31.9 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  30.18 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  31.86 
 
 		 324 aa  104  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 350 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  31.6 
 
 		 264 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.44 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  31.36 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  32.73 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>