More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1132 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  73.95 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  75.31 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  67.28 
 
 		 224 aa  308  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  41.74 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  41.28 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  42.18 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  42.18 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  43.32 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  42.45 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  43.32 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  40.33 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  39.45 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  37.87 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  39.63 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  37.26 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  40.8 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  35.44 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  36.92 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  35.48 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  39.44 
 
 		 541 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  30.77 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  32.72 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  34.87 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  35.14 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  34.93 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.95 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.5 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  34.55 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.36 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  33.79 
 
 		 356 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  35.92 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  36.23 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  36.46 
 
 		 337 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  36.79 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  33.85 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  33.96 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  34.48 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  40.37 
 
 		 571 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  34.27 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  33.86 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 353 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.95 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  34.67 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  35.71 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  35.61 
 
 		 366 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0212  ABC transporter related  35.03 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.18 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  31.36 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 		 353 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  36.41 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  33.33 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 365 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.41 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  30.18 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.33 
 
 		 399 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  34.39 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  34.58 
 
 		 353 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  32.02 
 
 		 365 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.21 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 		 354 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  34.08 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  30.85 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  32.89 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  40.35 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  33.33 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  29.82 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  33.16 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  32.56 
 
 		 867 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  30.05 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.48 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 353 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  30.53 
 
 		 351 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 353 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  31.88 
 
 		 345 aa  102  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  34.2 
 
 		 359 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1388  ABC transporter related  33.97 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  31.96 
 
 		 368 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  33.65 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.33 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  33.5 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  34.63 
 
 		 304 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  34.13 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>