More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2461 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  95.69 
 
 		 232 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  81.03 
 
 		 228 aa  347  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  58.3 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  59.29 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  37.04 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  37.33 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  36.65 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  36.87 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  36.41 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  34.43 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  33.96 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  33.96 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  36.67 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  42.05 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.71 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.37 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  37.37 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  36.84 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  38.6 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  38.14 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  39.29 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  36.61 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  38.22 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  36.74 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.03 
 
 		 367 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  40.44 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.44 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  37.5 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  37.24 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  35.87 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  40.33 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  38.04 
 
 		 368 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  38.19 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.29 
 
 		 356 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  39.2 
 
 		 495 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  38.97 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.44 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 343 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  36.96 
 
 		 368 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  37.56 
 
 		 564 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.08 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  36.23 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  41.38 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  37.69 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  38.61 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  45.81 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  35 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  35.2 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40.31 
 
 		 367 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  29.27 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.38 
 
 		 382 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.02 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  35.38 
 
 		 372 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 		 402 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.32 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 		 395 aa  101  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  39.71 
 
 		 460 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  36.92 
 
 		 542 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  44.38 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  41.28 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  41.28 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  35.71 
 
 		 364 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  39.8 
 
 		 367 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  38.12 
 
 		 355 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  37.78 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 		 333 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  36.76 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  40.69 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 		 354 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  39.8 
 
 		 367 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  35.75 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  39.8 
 
 		 367 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  39.8 
 
 		 367 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  34.87 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>