More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3881 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  83.05 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  83.05 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  82.2 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  82.63 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  79.66 
 
 		 235 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  78.81 
 
 		 235 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  79.24 
 
 		 235 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  77.97 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  63.26 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  63.72 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  65.4 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  60.35 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  58.8 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.64 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  40.64 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  41.15 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  32.86 
 
 		 334 aa  124  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  35.9 
 
 		 337 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  34.26 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  32.02 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  31.44 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  32.27 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  34.21 
 
 		 501 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  31.77 
 
 		 365 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  32.41 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  34.95 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  31.06 
 
 		 378 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  33.62 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  31.11 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  31.71 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  31.34 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  31.39 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  31.71 
 
 		 372 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.81 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  29.63 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  31.43 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  30.64 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  31.65 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  30.67 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  31.82 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  37.65 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.09 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  32.83 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  32.43 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  32.14 
 
 		 362 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  36.67 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  31.65 
 
 		 321 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  29.63 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  28.38 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  36.67 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  28.63 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  31.19 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  31.62 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.51 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2638  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.545525  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  32.8 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  31.36 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  33.83 
 
 		 356 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.49 
 
 		 316 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  32.91 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  33 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  29.28 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  30.52 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  36.21 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  32.87 
 
 		 356 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  30.57 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  30.93 
 
 		 355 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  35.15 
 
 		 311 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  32.16 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  32.16 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  32.24 
 
 		 363 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  30.93 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  32.16 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  30.93 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  32.16 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  27.98 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  31.25 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  36.9 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  27.98 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  36.9 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>