More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1023 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  76.25 
 
 		 242 aa  390  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  75.83 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  74.58 
 
 		 243 aa  378  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  74.58 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1149  ABC transporter-related protein  68.33 
 
 		 240 aa  347  8e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 241 aa  332  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  69.58 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  69.58 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  69.58 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.43 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  57.98 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.36 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  57.45 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.17 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.78 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.12 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  55.7 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.51 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  55.33 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  55.27 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  57.87 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  54.01 
 
 		 289 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.19 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  55.7 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  54.85 
 
 		 316 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  54.85 
 
 		 314 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.15 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  53.59 
 
 		 289 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  53.59 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.02 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  55.27 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  54.77 
 
 		 317 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  54.01 
 
 		 333 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.43 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  54.58 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 		 332 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  55.33 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  53.16 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.19 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.66 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  55.33 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  54.51 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  54.92 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  55.19 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  55.14 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  54.73 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.68 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  53.75 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  54.51 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  54.43 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.13 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  54.92 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  54.51 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  54.51 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  54.89 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  52.77 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 		 265 aa  264  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  53.31 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  54.32 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  53.16 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  54.92 
 
 		 260 aa  264  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.32 
 
 		 336 aa  264  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.51 
 
 		 268 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  54.24 
 
 		 244 aa  264  8.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 243 aa  264  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  53.59 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.53 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  54.66 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>