More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1149 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1149  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 		 242 aa  348  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  68.33 
 
 		 240 aa  347  8e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  67.92 
 
 		 242 aa  337  7e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  67.5 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.4 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  56.2 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  58.4 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 		 241 aa  274  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  54.77 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  56.43 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  54.77 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.81 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.79 
 
 		 241 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.02 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.44 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.61 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  52.7 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.02 
 
 		 259 aa  268  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.9 
 
 		 260 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.12 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.43 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  55.6 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.9 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  54.51 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  56.9 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.9 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.49 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  56.02 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  54.94 
 
 		 316 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.61 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  54.85 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  55.17 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.49 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.49 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.49 
 
 		 258 aa  264  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 249 aa  264  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 249 aa  264  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  55.27 
 
 		 258 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  55.27 
 
 		 258 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.49 
 
 		 258 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 241 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  55.17 
 
 		 317 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.2 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  54.85 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  53.78 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  53.69 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  53.69 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  55.27 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.47 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  54.96 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  55.27 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  54.74 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.49 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  55.27 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  53.62 
 
 		 239 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  55.19 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.85 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.85 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  54.77 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>