More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0852 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  80.58 
 
 
242 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  78.93 
 
 
243 aa  394  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  79.17 
 
 
242 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  75.83 
 
 
240 aa  380  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  77.27 
 
 
245 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  75.42 
 
 
241 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  77.27 
 
 
245 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  77.27 
 
 
245 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1149  ABC transporter-related protein  67.92 
 
 
240 aa  337  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.38 
 
 
244 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  54.51 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  56.96 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  55.19 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
261 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.12 
 
 
244 aa  271  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  54.1 
 
 
241 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  54.43 
 
 
317 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.38 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.79 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.38 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  56.38 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.38 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  53.56 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  54.01 
 
 
317 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  53.85 
 
 
258 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
243 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  55.56 
 
 
258 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  55.7 
 
 
244 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  53.85 
 
 
258 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  54.85 
 
 
243 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  54.01 
 
 
314 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  53.16 
 
 
333 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  55.56 
 
 
258 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  52.5 
 
 
243 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  55.56 
 
 
258 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.91 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  53.11 
 
 
242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.91 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
258 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.91 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.56 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  55.7 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.91 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  55.37 
 
 
263 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  53.59 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.91 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  54.62 
 
 
244 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.78 
 
 
239 aa  265  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.17 
 
 
268 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  53.11 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  53.59 
 
 
321 aa  264  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
242 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  55.37 
 
 
262 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  55 
 
 
266 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 
332 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.97 
 
 
258 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  53.16 
 
 
311 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  52.87 
 
 
241 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
241 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  53.16 
 
 
316 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  52.74 
 
 
283 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
246 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  50.63 
 
 
241 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  55.46 
 
 
268 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  53.33 
 
 
240 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.96 
 
 
241 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  53.53 
 
 
243 aa  262  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  51.64 
 
 
256 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
251 aa  262  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  54.13 
 
 
255 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  52.46 
 
 
264 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  53.16 
 
 
246 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  54.96 
 
 
262 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  52.97 
 
 
254 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
253 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  52.7 
 
 
241 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  54.51 
 
 
241 aa  260  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  52.3 
 
 
242 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
249 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  51.05 
 
 
253 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  53.16 
 
 
254 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>