More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0751 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  85 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  85 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  85 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  75.42 
 
 		 242 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  72.92 
 
 		 243 aa  363  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  70.42 
 
 		 242 aa  358  4e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  71.67 
 
 		 242 aa  357  8e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  68.75 
 
 		 240 aa  349  3e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1149  ABC transporter-related protein  64.17 
 
 		 240 aa  324  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  55.56 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  54.73 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  55 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  55.65 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.46 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  54.85 
 
 		 311 aa  277  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  55.92 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  53.59 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.07 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  54.85 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  53.47 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  54.81 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  55.65 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  55.46 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  53.97 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.58 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  54.69 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55.1 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.76 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  53.11 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  52.87 
 
 		 263 aa  269  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  54.69 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  53.59 
 
 		 289 aa  269  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  54.69 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  52.26 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  52.85 
 
 		 262 aa  269  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  54.29 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  52.26 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  53.75 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  54.43 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.72 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  54.77 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  54.29 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  53.16 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  53.56 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  53.47 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  53.88 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  52.5 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  54.29 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  53.88 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  53.16 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  53.14 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  53.16 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  53.88 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  52.32 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  52.48 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  53.31 
 
 		 244 aa  267  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.5 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  52.87 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  53.47 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  52.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  54.69 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  52.87 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  53.88 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  54.29 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  54.62 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  53.53 
 
 		 241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  52.65 
 
 		 251 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  53.33 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>