More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0840 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  69.1 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  61.3 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1697  ABC transporter related  61.74 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  53.68 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  48.46 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  48.71 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  47.37 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 332 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  48.29 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  48.68 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  48.68 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  46.98 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  49.34 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  47.81 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 243 aa  231  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  49.15 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  46.55 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  48.02 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  46.55 
 
 		 279 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  47.39 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  45.69 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  45.49 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  49.56 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  48.29 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  44.02 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  49.57 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  48.68 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 242 aa  228  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  48.71 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  51.11 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  46.98 
 
 		 289 aa  227  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  46.78 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  48.02 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 336 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  46.09 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  46.98 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  46.12 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  46.55 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  45.69 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  45.69 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  46.55 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  45.99 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  46.98 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  46.55 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  45.99 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  47.81 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  45.69 
 
 		 317 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  51.4 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  46.52 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  45.06 
 
 		 241 aa  224  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  46.29 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  45.81 
 
 		 321 aa  224  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  46.7 
 
 		 316 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  48.67 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.4 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  44.64 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  47.58 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 242 aa  223  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  45.99 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  47.37 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  46.12 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  46.29 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  44.21 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  47.86 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  45.49 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  46.09 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  45.02 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  46.7 
 
 		 271 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  44.83 
 
 		 256 aa  221  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  46.22 
 
 		 261 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 263 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  45.26 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>