More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0587 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  66.8 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  66.27 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  53.11 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  55.88 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.73 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  54.2 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  54.32 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  55.23 
 
 		 243 aa  275  8e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  53.36 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  54.66 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  56.3 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.14 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  50.62 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  56.15 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  58.4 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  53.14 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  51.26 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  49.16 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  51.88 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  51.68 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  54.81 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  55.33 
 
 		 333 aa  265  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  51.46 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  50.61 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  52.78 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.22 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  53.14 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  54.2 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  54.39 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  51.85 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.3 
 
 		 321 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.81 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  54.2 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  53.36 
 
 		 241 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  53.82 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.72 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.39 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  54.2 
 
 		 316 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  52.67 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  53.78 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  50.63 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  51.68 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  55.04 
 
 		 270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  52.76 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  52.44 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  52.24 
 
 		 310 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  52.4 
 
 		 264 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  258  6e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  51.26 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4168  ABC transporter, ATPase subunit  58.7 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  52.87 
 
 		 268 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  52.46 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.72 
 
 		 241 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.72 
 
 		 241 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  51.05 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  53.75 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.72 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  50.63 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.3 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  49.81 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  53.36 
 
 		 314 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  50.63 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  49.81 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  49.81 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  50.39 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  53.15 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>