More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0178 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  55.83 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  55.83 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.46 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.85 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  54.35 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  55.97 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  52.3 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.47 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.04 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.04 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  55.27 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  53.78 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  54.43 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  50.42 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  52.7 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  53.36 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  52.52 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  52.94 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  52.61 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  53.5 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  53.5 
 
 		 258 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.72 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  53.5 
 
 		 258 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.36 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  52.79 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 		 336 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.36 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  53.5 
 
 		 258 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  51.45 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  52.92 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.2 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  52.3 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  53.5 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  52.74 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 246 aa  267  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  53.5 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  54.27 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  52.32 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  51.9 
 
 		 333 aa  266  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  51.48 
 
 		 244 aa  266  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  52.32 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  50.83 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  52.32 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  51.9 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  52.65 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  53.09 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  49.16 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  51.24 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  53.16 
 
 		 254 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  51.88 
 
 		 253 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  52.67 
 
 		 258 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  51.9 
 
 		 317 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  54.01 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  51.26 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>