More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0828 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.7 
 
 
244 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  58.16 
 
 
243 aa  284  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 
246 aa  284  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.65 
 
 
239 aa  284  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 
245 aa  281  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  280  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  56.96 
 
 
244 aa  278  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  57.74 
 
 
247 aa  277  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55.27 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 
251 aa  272  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  55.79 
 
 
240 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  54.39 
 
 
244 aa  271  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.01 
 
 
244 aa  271  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  55.27 
 
 
249 aa  271  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  56.3 
 
 
277 aa  271  9e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 
246 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  55.22 
 
 
244 aa  269  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  54.62 
 
 
241 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.39 
 
 
243 aa  269  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  53.22 
 
 
240 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  54.81 
 
 
254 aa  268  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  55.37 
 
 
255 aa  268  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  54.2 
 
 
241 aa  268  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  53.78 
 
 
253 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  54.31 
 
 
252 aa  267  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  56.84 
 
 
239 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  54.96 
 
 
255 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  53.75 
 
 
265 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  55.27 
 
 
262 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  56.12 
 
 
263 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  55.27 
 
 
262 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  54.62 
 
 
241 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  54.43 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  54.01 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  55.88 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  53.78 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  56.12 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 
253 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  54.2 
 
 
253 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  53.97 
 
 
246 aa  265  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  54.01 
 
 
333 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.52 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.52 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.52 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.52 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.52 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  54.55 
 
 
242 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  55.27 
 
 
289 aa  264  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.09 
 
 
241 aa  264  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  52.92 
 
 
265 aa  264  8e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
241 aa  264  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  55.27 
 
 
282 aa  264  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 
332 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  56.03 
 
 
240 aa  264  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  55.27 
 
 
290 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  54.01 
 
 
317 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
247 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  54.01 
 
 
316 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  54.85 
 
 
289 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  53.91 
 
 
264 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.12 
 
 
244 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  51.9 
 
 
244 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  55.7 
 
 
283 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  54.58 
 
 
243 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  55.46 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  55.04 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  55.46 
 
 
258 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  54.62 
 
 
321 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  53.59 
 
 
271 aa  262  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  52.1 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  54.94 
 
 
247 aa  261  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  56.12 
 
 
246 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
336 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  54.35 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 
263 aa  261  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  56.65 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  52.59 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  52.26 
 
 
264 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  53.88 
 
 
317 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  55.7 
 
 
282 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.08 
 
 
241 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
245 aa  259  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
261 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  57.83 
 
 
242 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  52.74 
 
 
245 aa  259  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  52.46 
 
 
262 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  54.2 
 
 
261 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.78 
 
 
241 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.51 
 
 
241 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  53.36 
 
 
241 aa  258  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  52.46 
 
 
265 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  54.62 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>