More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1233 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  100 
 
 
242 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1246  ATPase  76.86 
 
 
242 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  74.79 
 
 
242 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 
242 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0772  ATPase  59.92 
 
 
244 aa  321  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.268568  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08241  ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
244 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.482577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08261  ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.196348  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08191  ABC transporter ATP-binding protein  54.96 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0169  ATPase  57.92 
 
 
241 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.655769  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08011  ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 
241 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.969375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  60.08 
 
 
243 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  60.08 
 
 
243 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  59.17 
 
 
250 aa  287  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  58.26 
 
 
242 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  58.09 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  55.79 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  54.13 
 
 
242 aa  268  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  54.55 
 
 
239 aa  265  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55.19 
 
 
241 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  52.07 
 
 
239 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  52.07 
 
 
243 aa  260  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  55.83 
 
 
241 aa  260  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  53.51 
 
 
244 aa  259  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  53.72 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  51.75 
 
 
244 aa  257  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
242 aa  256  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
246 aa  255  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
249 aa  254  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
246 aa  254  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  54.85 
 
 
243 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  52.48 
 
 
265 aa  254  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  50.83 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.04 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  50 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  52.48 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 
336 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 
242 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 
244 aa  251  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.92 
 
 
250 aa  251  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
241 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  250  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  53.33 
 
 
333 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  55.81 
 
 
241 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 
332 aa  249  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  52.92 
 
 
316 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 
242 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  52.28 
 
 
247 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  50.21 
 
 
244 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
240 aa  249  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  52.26 
 
 
241 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
245 aa  248  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
241 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 
246 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  50.82 
 
 
243 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  51.03 
 
 
241 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  49.79 
 
 
241 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  52.08 
 
 
249 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.83 
 
 
241 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  50.42 
 
 
243 aa  247  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  49.59 
 
 
241 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
246 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 
243 aa  246  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  52.5 
 
 
317 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  53.75 
 
 
251 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  50.41 
 
 
241 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  51.87 
 
 
246 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  52.08 
 
 
317 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
241 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
241 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  50.41 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  51.67 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 
255 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  52.5 
 
 
244 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  52.08 
 
 
314 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  48.55 
 
 
242 aa  244  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  51.04 
 
 
310 aa  244  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  48.96 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.41 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  49.59 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  48.33 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  54.15 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>