More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0772 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0772  ATPase  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.268568  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08261  ABC transporter ATP-binding protein  93.8 
 
 
242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.196348  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08241  ABC transporter ATP-binding protein  90.57 
 
 
244 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.482577  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08191  ABC transporter ATP-binding protein  81.82 
 
 
242 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  59.92 
 
 
242 aa  321  6e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 
242 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1246  ATPase  58.68 
 
 
242 aa  311  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08011  ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 
241 aa  294  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.969375 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0169  ATPase  57.5 
 
 
241 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.655769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  54.96 
 
 
250 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  56.73 
 
 
242 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  55.14 
 
 
243 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  55.14 
 
 
243 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  53.33 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  52.48 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.26 
 
 
243 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  50.41 
 
 
242 aa  257  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  50.21 
 
 
243 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
245 aa  255  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 
245 aa  254  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  48.76 
 
 
241 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  51.04 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  48.76 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  49.59 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
243 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  51.23 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.95 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  48.56 
 
 
243 aa  251  6e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  51.24 
 
 
247 aa  251  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
241 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  48.76 
 
 
241 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  48.36 
 
 
241 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.42 
 
 
241 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.5 
 
 
250 aa  250  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  47.93 
 
 
241 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  50.83 
 
 
246 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 
241 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  51.75 
 
 
244 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.76 
 
 
241 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  51.77 
 
 
239 aa  248  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  47.93 
 
 
241 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50 
 
 
241 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  49.58 
 
 
271 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  47.52 
 
 
241 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
241 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
251 aa  246  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
265 aa  246  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  50.83 
 
 
239 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  51.77 
 
 
244 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  47.52 
 
 
241 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  49.17 
 
 
243 aa  246  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  51.32 
 
 
244 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  51.32 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  49.38 
 
 
241 aa  245  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  47.72 
 
 
241 aa  244  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  49.12 
 
 
241 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
242 aa  244  8e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  49.38 
 
 
241 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  51.02 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.16 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  51.64 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  51.64 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  51.64 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  51.64 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  50.21 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  48.33 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  50.23 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.17 
 
 
241 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.17 
 
 
241 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 
243 aa  242  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  48.76 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  51.42 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  51.42 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  49.59 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>