More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0169 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0169  ATPase  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.655769  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08011  ABC transporter ATP-binding protein  97.51 
 
 		 241 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.969375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08241  ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.482577  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  57.92 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08191  ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0772  ATPase  57.5 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.268568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1246  ATPase  57.08 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08261  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.196348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  52.54 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  51.45 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  51.45 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  51.87 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  53.11 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  51.04 
 
 		 242 aa  254  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.41 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  51.45 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  51.25 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  48.32 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  52.65 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  51.45 
 
 		 247 aa  247  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  51.05 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  51.45 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  49.58 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  52.5 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  51.68 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  49.79 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  49.17 
 
 		 242 aa  241  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  51.04 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  50.66 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  48.95 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  50.66 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  49.79 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  48.55 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  48.95 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  50.7 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  50 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  47.28 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  47.92 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  48.33 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  48.95 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  50 
 
 		 277 aa  234  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  47.79 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  51.29 
 
 		 240 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  51.75 
 
 		 239 aa  234  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  47.08 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  53.52 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  47.52 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  47.72 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  45.53 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  50.43 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  47.54 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  46.86 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 336 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  47.54 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  48.48 
 
 		 321 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  47.08 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  48.35 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  45.53 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  47.06 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  48.76 
 
 		 316 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  49.78 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  47.9 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  44.96 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  47.9 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  47.93 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  46.28 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  46.67 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  48.76 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  49.56 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.92 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  48.57 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.5 
 
 		 241 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  47.9 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  47.48 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  48.57 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  47.06 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  47.93 
 
 		 317 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>