More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2082 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  100 
 
 
221 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
235 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  41.55 
 
 
235 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  41.55 
 
 
235 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  41.55 
 
 
235 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  40.2 
 
 
239 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
238 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  40.82 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  40.51 
 
 
236 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  39.9 
 
 
236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  41.15 
 
 
236 aa  148  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 
239 aa  147  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  36.45 
 
 
248 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.32 
 
 
239 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  37.32 
 
 
239 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 
240 aa  141  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
224 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  41.92 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.38 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.87 
 
 
316 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  40.28 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  40.33 
 
 
251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 
337 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.33 
 
 
316 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.26 
 
 
331 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.21 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  32.23 
 
 
236 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  38.25 
 
 
244 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.12 
 
 
319 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 
365 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  34.15 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  30.14 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  37.98 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  30.52 
 
 
236 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.58 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.07 
 
 
329 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  39.5 
 
 
229 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
239 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.94 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  36.45 
 
 
249 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 
321 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  36.95 
 
 
249 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 
246 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  38.1 
 
 
326 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  38.18 
 
 
250 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  28.5 
 
 
241 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  36.36 
 
 
335 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  37.62 
 
 
326 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
317 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  36.27 
 
 
240 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  37.91 
 
 
238 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.54 
 
 
323 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  37.91 
 
 
305 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  30.19 
 
 
243 aa  105  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  28.91 
 
 
325 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2121  ABC transporter related  34.6 
 
 
316 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.67463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.01 
 
 
527 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  33.99 
 
 
240 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  30.35 
 
 
266 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  37.91 
 
 
238 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  41.24 
 
 
318 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  34.78 
 
 
242 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  30.66 
 
 
317 aa  104  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
321 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  36.07 
 
 
238 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  36.49 
 
 
314 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  33.49 
 
 
320 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  35.92 
 
 
302 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  32.51 
 
 
237 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  31.53 
 
 
289 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  33.49 
 
 
320 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
305 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
334 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
334 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  36.36 
 
 
222 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  30.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  28.19 
 
 
277 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  32.2 
 
 
310 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.19 
 
 
314 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 
240 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  35.44 
 
 
302 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  35.44 
 
 
302 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.48 
 
 
328 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  34.11 
 
 
339 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  38.04 
 
 
553 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  32.09 
 
 
245 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2666  ABC transporter related  35.33 
 
 
342 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
340 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  36.67 
 
 
318 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  33.66 
 
 
243 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  34.27 
 
 
244 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  34.42 
 
 
344 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  37.56 
 
 
317 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  36.63 
 
 
401 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>