More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2479 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  100 
 
 		 339 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2734  ABC transporter related  92.33 
 
 		 339 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.367354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1946  ABC transporter related  66.95 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  51.31 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  48.26 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  48.12 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  48.95 
 
 		 382 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  48.59 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  43.14 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  43.71 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  45.31 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  45.43 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  51.02 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  43.12 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.86 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.99 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  45.4 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  45.06 
 
 		 361 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  49.18 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  45.17 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 363 aa  241  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  45.37 
 
 		 361 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  39.48 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  42.21 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  41.47 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  47.06 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.17 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  51.25 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  41.88 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  42.86 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  39.88 
 
 		 394 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.66 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.98 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  50.82 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.96 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.67 
 
 		 358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.23 
 
 		 366 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  39.47 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.38 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  39.42 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  41.87 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  40.68 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.28 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.21 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  42.21 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  41.82 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.98 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1589  ABC transporter related  48 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.91 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  46.53 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.11 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 363 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  37.57 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  48.36 
 
 		 365 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 364 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.88 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.57 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 353 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 		 357 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.48 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  41.12 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  43.03 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.59 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.5 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.12 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  39.72 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.68 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  39.94 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3962  ABC transporter related  40.98 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>