More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4721 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  91.49 
 
 		 235 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  91.49 
 
 		 235 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  91.91 
 
 		 235 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  77.97 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  77.97 
 
 		 236 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  77.97 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  77.54 
 
 		 236 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  77.97 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  62.03 
 
 		 238 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  57.56 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  63.55 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  57.56 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  58.59 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.77 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  40.51 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  40.61 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  33.49 
 
 		 334 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  32.26 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  34.1 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  31.49 
 
 		 247 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  34.58 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  35.5 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  36.41 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  32.29 
 
 		 365 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.98 
 
 		 501 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  33.8 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  30.5 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  34.26 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.58 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  31.05 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  32.29 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  33.85 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  34.74 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 		 355 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  31.13 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 		 355 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  30.41 
 
 		 362 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  31.19 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  32.87 
 
 		 359 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  33.01 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  33.81 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  33.04 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  32.52 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  35.57 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  33.63 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  30.45 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  31.98 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.59 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.13 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  31.46 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.03 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.7 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  35.54 
 
 		 372 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  36.65 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  31 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  30.56 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  31.65 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  31.25 
 
 		 333 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  33.33 
 
 		 355 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  36.67 
 
 		 325 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  33.81 
 
 		 355 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  33.17 
 
 		 372 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  29.56 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  35.56 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  30.61 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  28.87 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.84 
 
 		 212 aa  102  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  29.65 
 
 		 353 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  32.42 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  33.51 
 
 		 393 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  30.41 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  36.14 
 
 		 357 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  31.53 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  32.86 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  31.88 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>