More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2322 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  76.02 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  77.55 
 
 		 254 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  76.02 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  68 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  68.95 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  65.43 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  64.61 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  65.84 
 
 		 251 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  61.87 
 
 		 262 aa  309  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  61.29 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  58.63 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  59.68 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  59.68 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  60.43 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  59.68 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  60.08 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  58.87 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  57.65 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.1 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  58.13 
 
 		 255 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  55.69 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  55.87 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  55.79 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  59.15 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  57.55 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  54.55 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  55.69 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  54.22 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  54.72 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  57.21 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  53.94 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  51.63 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  51.22 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  53.54 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  53.75 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.75 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  52.26 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  51.85 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  53.45 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.49 
 
 		 332 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 321 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2994  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 360 aa  214  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.3 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.3 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 334 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  52.8 
 
 		 234 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  43.54 
 
 		 308 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.54 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  48.48 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.02 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.29 
 
 		 571 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.13 
 
 		 342 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  43.6 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.61 
 
 		 539 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.14 
 
 		 325 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  44.18 
 
 		 311 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.78 
 
 		 366 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  48.32 
 
 		 350 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.92 
 
 		 539 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 308 aa  207  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.54 
 
 		 539 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0116  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.251673  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  49.79 
 
 		 539 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.38 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19042  hitchhiker  0.00501998 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.68 
 
 		 322 aa  205  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 		 346 aa  205  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>