More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3367 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  85.07 
 
 
269 aa  447  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  85.07 
 
 
269 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  74.1 
 
 
257 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  68.65 
 
 
255 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  67.46 
 
 
258 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  67.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  55.65 
 
 
262 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  53.47 
 
 
256 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  57.66 
 
 
253 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  54.76 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  54.51 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  54.72 
 
 
255 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56.45 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  55.97 
 
 
252 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  56.85 
 
 
253 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.65 
 
 
255 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  56.38 
 
 
246 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  55.2 
 
 
249 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  54 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  55.14 
 
 
246 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.44 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 
260 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
262 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
262 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
255 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
255 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  52.59 
 
 
251 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  53.28 
 
 
254 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  55.12 
 
 
257 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  54.03 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  54.25 
 
 
251 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  54.39 
 
 
246 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  52.42 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  52.76 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  53.63 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  53.44 
 
 
251 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  52.67 
 
 
247 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  51.81 
 
 
260 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  54.63 
 
 
250 aa  244  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  52.42 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  52.26 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  52.61 
 
 
255 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.69 
 
 
252 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  50.68 
 
 
248 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
338 aa  215  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
340 aa  215  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
292 aa  215  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
539 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  54.34 
 
 
228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0845  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.91 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0435926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0152  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.74 
 
 
616 aa  211  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
342 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  48.74 
 
 
547 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
349 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  53.18 
 
 
234 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 
321 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
316 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
346 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 
336 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756005  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  48.32 
 
 
544 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  48.32 
 
 
544 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
347 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 
336 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  46.41 
 
 
328 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  51.8 
 
 
246 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
559 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.31 
 
 
562 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  41.9 
 
 
309 aa  206  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  46.86 
 
 
555 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
344 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
344 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
329 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
322 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
320 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  43.87 
 
 
575 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.64 
 
 
327 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 
339 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
571 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
311 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  47.9 
 
 
544 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  43.8 
 
 
573 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
328 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 
543 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.95 
 
 
566 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  47.03 
 
 
544 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  46.67 
 
 
530 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 
332 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  46.67 
 
 
530 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  43.97 
 
 
583 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>