More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3252 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  72.58 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  69.51 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  66.39 
 
 		 257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  67.35 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  67.62 
 
 		 269 aa  328  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  61.94 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  66.8 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  59.43 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  59.18 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  58.78 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  56.97 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  59.18 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  58.02 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  59.47 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  55.37 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  55.97 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  54.55 
 
 		 256 aa  278  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  57.61 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  57.61 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  57.61 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  57.61 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.49 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  57.61 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  55.97 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  56.79 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  53.2 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.56 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 255 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.38 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  55.56 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  55.87 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  58.93 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  54.25 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.92 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  56.38 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.73 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  54.32 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  53.12 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  52.74 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 		 347 aa  222  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.35 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.35 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.9 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  51.12 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  46.47 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  50.82 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 333 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 368 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  49.1 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 344 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 344 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.64 
 
 		 333 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 355 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 571 aa  207  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  42.48 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 321 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 		 322 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  44.71 
 
 		 571 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  52.49 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 		 321 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0152  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 571 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 536 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  48.9 
 
 		 288 aa  204  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  42 
 
 		 311 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.13 
 
 		 326 aa  204  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.83 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  45.34 
 
 		 565 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  43.14 
 
 		 566 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 		 328 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>