More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1008 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  92.91 
 
 
282 aa  527  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  99.62 
 
 
276 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  60.45 
 
 
350 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  59.54 
 
 
276 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  57.75 
 
 
285 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  57.65 
 
 
308 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  57.75 
 
 
285 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  57.36 
 
 
285 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  58.8 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
321 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5646  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  53.82 
 
 
330 aa  278  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  53.54 
 
 
536 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  51.66 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
308 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  49.65 
 
 
611 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.55 
 
 
362 aa  270  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  50.75 
 
 
611 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.29 
 
 
308 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.34 
 
 
347 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  50.38 
 
 
611 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  51.15 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 
308 aa  268  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  53.76 
 
 
544 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 
323 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  51.69 
 
 
313 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.92 
 
 
307 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3107  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.97 
 
 
328 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.170361  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  49.22 
 
 
270 aa  266  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
328 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.840124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2551  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
322 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  48.33 
 
 
332 aa  265  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  50 
 
 
322 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  48.33 
 
 
332 aa  265  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.82 
 
 
349 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0613  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
336 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
337 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
330 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  51.15 
 
 
336 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  50 
 
 
282 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 
338 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 
327 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.07 
 
 
322 aa  263  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002963  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  50.76 
 
 
331 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  50.19 
 
 
282 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 
328 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  53.05 
 
 
265 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
346 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  51.53 
 
 
549 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  51.91 
 
 
611 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7775  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.27 
 
 
419 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
611 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
611 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 
611 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.24 
 
 
282 aa  262  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
337 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 
339 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 
326 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.663294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1011  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 
326 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.289236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  54.27 
 
 
337 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.77 
 
 
316 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.75 
 
 
338 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 
344 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.18 
 
 
337 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.6 
 
 
617 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
444 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.62 
 
 
366 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  50.77 
 
 
336 aa  259  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 
339 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.01 
 
 
478 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.45 
 
 
330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
623 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  49.62 
 
 
329 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.536054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.59 
 
 
328 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
332 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  49.81 
 
 
308 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.87 
 
 
340 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  55.81 
 
 
527 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 
329 aa  259  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.64 
 
 
317 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
336 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
346 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.04 
 
 
332 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0481  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.07 
 
 
333 aa  258  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000513097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 
332 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  48.89 
 
 
612 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 
443 aa  258  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
370 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.58 
 
 
323 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
319 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
364 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
345 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>