More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4008 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  76.83 
 
 
260 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  76.54 
 
 
260 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  73.33 
 
 
258 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  73.49 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  73.49 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  73.49 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  73.49 
 
 
258 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  72.44 
 
 
253 aa  351  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  73.39 
 
 
253 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  70.16 
 
 
255 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  70.16 
 
 
262 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  70.16 
 
 
262 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  70.16 
 
 
262 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  69.76 
 
 
262 aa  330  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  69.76 
 
 
262 aa  330  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  69.76 
 
 
255 aa  330  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  69.76 
 
 
255 aa  330  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  68.15 
 
 
252 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  57.89 
 
 
254 aa  284  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  59.92 
 
 
251 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  59.11 
 
 
251 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  58 
 
 
251 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  58.04 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  59.84 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  59.51 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  55.69 
 
 
255 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  57.03 
 
 
249 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  57.61 
 
 
256 aa  271  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  56.22 
 
 
249 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  55.38 
 
 
250 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
254 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  58.58 
 
 
246 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  58.67 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.96 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  53.12 
 
 
258 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  58.26 
 
 
246 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  57.26 
 
 
247 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.85 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  51.17 
 
 
257 aa  251  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  53.39 
 
 
255 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 
260 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  53.91 
 
 
265 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.2 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
269 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  52.61 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.65 
 
 
248 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  50.81 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  52.26 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  52.23 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  51.85 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  45.31 
 
 
572 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
587 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  52.23 
 
 
234 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
339 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  44.62 
 
 
541 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  51.33 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.75 
 
 
566 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.33 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.33 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0119  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0814918  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
334 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4734  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
339 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5322  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.64 
 
 
339 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
339 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  40.73 
 
 
530 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  40.73 
 
 
530 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
695 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
544 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4862  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 
340 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5409  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 
340 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
571 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.08 
 
 
575 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 
602 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
335 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  51.54 
 
 
246 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  46.38 
 
 
545 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
311 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.28 
 
 
327 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
549 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
368 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
339 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 
339 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231305  normal  0.0278452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.81 
 
 
566 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 
348 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  47.66 
 
 
629 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  44.27 
 
 
593 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  43.92 
 
 
571 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  43.02 
 
 
544 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  45.85 
 
 
532 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
292 aa  191  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 
543 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 
549 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
311 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
311 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>