More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3555 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  99.58 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  99.58 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  68.91 
 
 		 234 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  61.26 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  60.89 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  57.46 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  58.04 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  54.35 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  53.48 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  50.81 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  52.42 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  51.72 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  53.07 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  53.6 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  52.19 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  50.84 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  53.95 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  50.22 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  50.87 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  50.87 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  50.43 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  49.12 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  51.08 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  53.51 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  49.57 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  52.02 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  48.05 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  51.29 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  50.87 
 
 		 260 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 258 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  50.87 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  49.15 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  52.25 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  48.72 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  48.72 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  49.15 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  48.72 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  53.23 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  49.13 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  51.06 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  48.29 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  50.48 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  53.73 
 
 		 249 aa  213  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  51.33 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1762  ABC transporter related  49.77 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 329 aa  208  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  50 
 
 		 617 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.06 
 
 		 328 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.14 
 
 		 313 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 602 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  48.7 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 321 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 		 325 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 		 326 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.4 
 
 		 368 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  44.26 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.84 
 
 		 571 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  50.22 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.93 
 
 		 337 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3508  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  44.58 
 
 		 617 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.45 
 
 		 566 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  44.21 
 
 		 627 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.88 
 
 		 345 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4734  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 		 736 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5322  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.4 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.343189  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 321 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 339 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231305  normal  0.0278452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 		 347 aa  198  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 321 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.897855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 		 323 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  44 
 
 		 292 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 332 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  42.15 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.06 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.76 
 
 		 426 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0119  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 339 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0814918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.09 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.55 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.92 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0417  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 327 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777417  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.11 
 
 		 572 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>