More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3202 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  58.82 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  57.56 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  56.64 
 
 		 246 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  54.44 
 
 		 262 aa  245  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  56.19 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.7 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  56.3 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  53.75 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  52.23 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  52.92 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  52.72 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  53.68 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  54.73 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  54.55 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  52.91 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  54.11 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  51.34 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  51.25 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  50.62 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  53.25 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  53.68 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  53.68 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  53.68 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  51.33 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  52.08 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  50.68 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  53.39 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  52.65 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  52.81 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  52 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  48.39 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.91 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  52.81 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 262 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 262 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  53.42 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  47.92 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  52.3 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.48 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  55.61 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  50.48 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  50.48 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 		 339 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 354 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.04 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.13 
 
 		 332 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  41.7 
 
 		 522 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  45.85 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  48.42 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  45.15 
 
 		 288 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  44.5 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 329 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 		 347 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 680 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3885  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 		 326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.171572  normal  0.0376469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.2 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  44.69 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 		 338 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 336 aa  181  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 313 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.41 
 
 		 627 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.76 
 
 		 346 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.98 
 
 		 327 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 602 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  45.41 
 
 		 345 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.23 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.91 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.16 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 536 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.69 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0943  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2403  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 425 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  42.25 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 		 350 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>