More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4021 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  95.33 
 
 		 258 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  95.33 
 
 		 258 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  95.33 
 
 		 258 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  97.21 
 
 		 253 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  93.8 
 
 		 258 aa  480  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  94.05 
 
 		 253 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  82.45 
 
 		 252 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  79.6 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  76.21 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  77.42 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  73.33 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  60.73 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  60.57 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  60.94 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  60.16 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  58.68 
 
 		 256 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  61.94 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  61.29 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  64.26 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  58.54 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  62.61 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  57.2 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  58.23 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  61.92 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  61.16 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  55.69 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 254 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  60.67 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.96 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  56.45 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  55.14 
 
 		 265 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  58.41 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.05 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  59.11 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.45 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  56.71 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  55.65 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.81 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  47.24 
 
 		 572 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.28 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  50.62 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  45.7 
 
 		 531 aa  215  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  48.84 
 
 		 539 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 543 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  46.74 
 
 		 541 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  47.29 
 
 		 540 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.09 
 
 		 327 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 544 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  47.67 
 
 		 540 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  47.67 
 
 		 540 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  47.27 
 
 		 535 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  49.58 
 
 		 544 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  46.88 
 
 		 535 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 		 540 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.93 
 
 		 539 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  47.67 
 
 		 540 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.95 
 
 		 566 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  42.34 
 
 		 530 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  42.34 
 
 		 530 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  49.79 
 
 		 537 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 676 aa  206  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  44 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 534 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1385  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 		 335 aa  205  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  47.01 
 
 		 571 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 549 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.45 
 
 		 537 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  46.51 
 
 		 540 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.82 
 
 		 571 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.75 
 
 		 347 aa  204  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.09 
 
 		 336 aa  204  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0116  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.251673  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0066  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 		 355 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  50.44 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 549 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  46.15 
 
 		 566 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>