More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3533 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  69.96 
 
 		 258 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  68.65 
 
 		 268 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  69.51 
 
 		 254 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  68.53 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  65.23 
 
 		 257 aa  348  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  68.92 
 
 		 269 aa  330  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  60.08 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  59.58 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  57.02 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  58.13 
 
 		 255 aa  284  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  58.78 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  61.14 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  60.53 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  54.92 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  57.5 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  57.96 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  55.69 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  55.28 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  57.31 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  60.26 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  57.2 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  55.6 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.36 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  57.21 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  57.14 
 
 		 251 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  58.01 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  56.79 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  54.84 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  54.84 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  54.84 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  57.14 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.71 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  55.97 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  54.03 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  54.22 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  55.14 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  53.39 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  51.81 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  54.47 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  51.33 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  52.16 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  52.16 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  49.78 
 
 		 572 aa  224  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.35 
 
 		 321 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  52.56 
 
 		 285 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  52.56 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  51.29 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  51.72 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 320 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  45.42 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  45.69 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2128  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  50 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.96 
 
 		 568 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  47.66 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  47.19 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  50.43 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  54.72 
 
 		 246 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.27 
 
 		 334 aa  218  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 332 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 347 aa  218  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 326 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 539 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  49.57 
 
 		 308 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50.86 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.94 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 308 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  53.21 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 308 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  48.72 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>