More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4483 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  96.44 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  96.44 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  97.21 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  96.44 
 
 
258 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  95.65 
 
 
258 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  94.07 
 
 
253 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  84.49 
 
 
252 aa  417  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
262 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  83.06 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  83.06 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  79.6 
 
 
255 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  75 
 
 
260 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  76.61 
 
 
260 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  73.39 
 
 
255 aa  351  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  60.57 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  59.92 
 
 
254 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  62.75 
 
 
251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  61.94 
 
 
251 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  62.75 
 
 
251 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  58.68 
 
 
256 aa  295  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  59.35 
 
 
249 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  63.98 
 
 
257 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  62.61 
 
 
250 aa  288  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  58.87 
 
 
255 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  59.44 
 
 
251 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  61.51 
 
 
246 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  56.4 
 
 
257 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  56.79 
 
 
265 aa  274  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  56.05 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 
254 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  60.74 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  59.73 
 
 
258 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  60.25 
 
 
246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  56.85 
 
 
268 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  57.83 
 
 
269 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.96 
 
 
249 aa  265  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 
260 aa  265  8e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  59.11 
 
 
249 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  55.65 
 
 
247 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  57.14 
 
 
255 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.05 
 
 
247 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  57.43 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  53.25 
 
 
248 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.69 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  52.17 
 
 
572 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  51.69 
 
 
539 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
544 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  47.67 
 
 
540 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 
540 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  49.38 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  48.06 
 
 
540 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  48.06 
 
 
540 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
543 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 
327 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  47.67 
 
 
540 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  49.58 
 
 
544 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
539 aa  211  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  42.74 
 
 
530 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  42.74 
 
 
530 aa  210  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.31 
 
 
336 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
549 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
329 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0066  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
303 aa  209  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
311 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  53.85 
 
 
234 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
571 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  44.71 
 
 
571 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  46.12 
 
 
540 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
347 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
368 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.58 
 
 
531 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  46.12 
 
 
540 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  46.91 
 
 
578 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  45.59 
 
 
541 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  49.15 
 
 
238 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  49.57 
 
 
565 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.52 
 
 
566 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  46.25 
 
 
617 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  50.44 
 
 
527 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>