More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3381 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  493  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  59.57 
 
 
238 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  59.57 
 
 
238 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  58.9 
 
 
238 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  64.76 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  59.29 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  56.71 
 
 
251 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
254 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  54.1 
 
 
249 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  58.59 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  57.76 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  55.04 
 
 
247 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  55.88 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  54.13 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  56.02 
 
 
251 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  58.33 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  52.74 
 
 
254 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  53.78 
 
 
257 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  53.45 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  54.15 
 
 
256 aa  235  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  51.98 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  52.87 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  55.09 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  53.08 
 
 
250 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  54.98 
 
 
258 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  52.7 
 
 
268 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  53.6 
 
 
246 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
269 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  53.21 
 
 
246 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  54.09 
 
 
246 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  48.96 
 
 
249 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.11 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  52.44 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  55.61 
 
 
248 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  49 
 
 
260 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  50.9 
 
 
265 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  55.34 
 
 
258 aa  214  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  52.81 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  48.56 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  46.31 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  51.08 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  55.5 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  51.54 
 
 
258 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  51.54 
 
 
258 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  51.54 
 
 
258 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  55.5 
 
 
258 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  51.54 
 
 
255 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  52.75 
 
 
255 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  49.15 
 
 
269 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1762  ABC transporter related  51.77 
 
 
233 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  50.91 
 
 
262 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
262 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
262 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 
308 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
255 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
255 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  49.51 
 
 
536 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.44 
 
 
252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  48.4 
 
 
527 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 
321 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  44.67 
 
 
308 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
308 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
308 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
308 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
308 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
308 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 
391 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
340 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  45.19 
 
 
686 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1798  ABC transporter related  49.12 
 
 
227 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  45.61 
 
 
686 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  44.26 
 
 
308 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.39 
 
 
328 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 
329 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
326 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.42 
 
 
368 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
352 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.05 
 
 
337 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 
368 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  47.83 
 
 
572 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 
602 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 
308 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.02 
 
 
571 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 
676 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  42.79 
 
 
270 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
347 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  48.85 
 
 
273 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  50 
 
 
337 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3421  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 
369 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
609 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  48.76 
 
 
308 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 
478 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
426 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
601 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
328 aa  188  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>