More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4176 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  91.97 
 
 		 249 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  77.96 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  76.02 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  69.92 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  68.44 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  65.59 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  65.18 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  65.18 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  60.57 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  60.57 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  60.57 
 
 		 253 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  60.16 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  59.68 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  60.24 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  58.7 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  58.13 
 
 		 260 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  60.41 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  58.94 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  61.23 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  56.38 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  59.15 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  61.14 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  58.3 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  55.14 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  58.37 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  56.22 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  57.21 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  54 
 
 		 268 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  54.29 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.66 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  53.66 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  55.9 
 
 		 269 aa  254  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.92 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  54.88 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  54.1 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  52.42 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  51 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  50.2 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0116  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.251673  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.55 
 
 		 342 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  51.32 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  50.87 
 
 		 238 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  45.41 
 
 		 572 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.75 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  45.56 
 
 		 544 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  45.56 
 
 		 544 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 539 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 311 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 602 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  45.17 
 
 		 544 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  45.02 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 559 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  41.7 
 
 		 530 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  41.7 
 
 		 530 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 547 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.84 
 
 		 571 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  42.64 
 
 		 270 aa  204  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 334 aa  204  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 311 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.25 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  46.15 
 
 		 555 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 		 333 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  45.89 
 
 		 575 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  45.42 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  47.66 
 
 		 539 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 316 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 539 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 549 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3633  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  46.9 
 
 		 527 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>