More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0803 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  98.01 
 
 		 251 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  93.57 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  68.42 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  65.18 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  64.71 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  64.78 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  61.98 
 
 		 254 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  64.61 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  64.37 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  61.94 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  60.55 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  61.54 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  61.38 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  59.92 
 
 		 256 aa  294  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  60.82 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  61.7 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  59 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.4 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  61.28 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  58.7 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  59.92 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.79 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  57.08 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  59.11 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  57.96 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  57.61 
 
 		 265 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  55.69 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.97 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.97 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  53.33 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 269 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  53.44 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  55.97 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  55.14 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  56.3 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  56.48 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  52.44 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  53.91 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  53.91 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  55.42 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  53.48 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  49.03 
 
 		 532 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 		 602 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 		 321 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  55.09 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.99 
 
 		 531 aa  215  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 		 339 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231305  normal  0.0278452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 292 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  47.91 
 
 		 543 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.35 
 
 		 566 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  47.91 
 
 		 543 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  47.91 
 
 		 543 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2215  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 376 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.687809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  46.12 
 
 		 311 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.1 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.92 
 
 		 575 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  41.31 
 
 		 322 aa  210  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  50.42 
 
 		 539 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0119  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 		 339 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0814918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  46.64 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  50.21 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  50 
 
 		 539 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.570854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0223  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 		 321 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  46.67 
 
 		 527 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.07 
 
 		 368 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  47.21 
 
 		 527 aa  208  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  48.71 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1324  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1573  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238612  normal  0.0236342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7207  ABC transporter  48.95 
 
 		 344 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.75 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>