More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0803 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  53.97 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  51.63 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  54.47 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  54.88 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  54.66 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  51.9 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  54.39 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  53.69 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  55.83 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  55.42 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  53.69 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  54.1 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  54.1 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  54.1 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  55 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  54.51 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  53.75 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  54.07 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  53.69 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  53.69 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  53.69 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  53.69 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  52.72 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  53.28 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  49.58 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  52.72 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  51.24 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  51.24 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  53.88 
 
 		 265 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  53.36 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  52.23 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.3 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  51.23 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  52.46 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  50.4 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  52.86 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  50.4 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  50.87 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.43 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  50.62 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 539 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  46.3 
 
 		 572 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 311 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.78 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  46.02 
 
 		 573 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  53 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  43.17 
 
 		 311 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 311 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.35 
 
 		 332 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  47.83 
 
 		 617 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.93 
 
 		 627 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.64 
 
 		 562 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  45.69 
 
 		 583 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.25 
 
 		 531 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 571 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  46.81 
 
 		 530 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.19 
 
 		 571 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  48.31 
 
 		 308 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  43.35 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  47.5 
 
 		 530 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  45.42 
 
 		 527 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  46.08 
 
 		 578 aa  184  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.03 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  42.62 
 
 		 566 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  45.83 
 
 		 617 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 		 329 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.02 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.7 
 
 		 326 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  48.57 
 
 		 536 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  43.85 
 
 		 544 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  43.85 
 
 		 544 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 		 307 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.26 
 
 		 619 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 340 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.98385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>