More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5438 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  91.09 
 
 
247 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  55.69 
 
 
255 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  55.79 
 
 
256 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  55.97 
 
 
265 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  57.03 
 
 
251 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  58.23 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  56.1 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  59.49 
 
 
246 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  58.65 
 
 
246 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  54.44 
 
 
257 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  57.38 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  58.85 
 
 
250 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  56.97 
 
 
251 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
260 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  54.29 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  56.97 
 
 
251 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  56.85 
 
 
260 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  59.38 
 
 
249 aa  260  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  56.05 
 
 
253 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  57.66 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  52.24 
 
 
254 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  53.63 
 
 
269 aa  258  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  54.25 
 
 
249 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56.05 
 
 
258 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  57.26 
 
 
255 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  55.65 
 
 
258 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  55.65 
 
 
258 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  55.65 
 
 
258 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  55.97 
 
 
252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  55.74 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.22 
 
 
255 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
262 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  53.63 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  55.24 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  51.22 
 
 
255 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.73 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  54.32 
 
 
247 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  53.63 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  54.15 
 
 
257 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
343 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  52.21 
 
 
331 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  53.14 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.24 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  47.92 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  49.78 
 
 
352 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.788659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
336 aa  214  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  51.07 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.98 
 
 
368 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 
602 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  50.63 
 
 
712 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
337 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
329 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  53.33 
 
 
340 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 
223 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  45.61 
 
 
308 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
339 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  47.93 
 
 
540 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 
332 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  44.71 
 
 
328 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
344 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
344 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.07 
 
 
364 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.67 
 
 
333 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.85 
 
 
337 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
339 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 
321 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
311 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  46.29 
 
 
310 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
347 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  51.49 
 
 
238 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  51.49 
 
 
238 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 
339 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 
337 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
334 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.47 
 
 
332 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.89 
 
 
327 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
355 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 
342 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1004  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
323 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 
338 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0811  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
326 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
321 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 
905 aa  202  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
311 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>